敲除/敲低验证做在哪几条细胞系上，直接决定结论的说服力。推荐的选系流程是：疾病组织 → 依赖概率 → 表达水平 → 拷贝数状态，四步都用本站工具即可完成。

第一步：锁定疾病相关组织

在评估结果的逐细胞表中，先用"组织"下拉过滤到你的研究方向（如肝癌选 liver）。优先在自源组织里找高依赖细胞系，结论的临床相关性最强；如果该组织没有可用模型，再放宽到相邻 lineage。

第二步：用依赖概率排序

在「基因风险评估」（/GeneRisk）逐细胞表中取概率 > 0.8 的系。注意避开两类干扰：泛必需基因的"全员高概率"，以及仅剩孤证的系（该系其它数据质量未确认时）。

第三步：确认靶基因真的表达

到「基因表达量评估」（/GeneExpr）查同一批系的 TPM：

  • TPM > 10：蛋白层面大概率可检出，适合做 western / 功能实验；
  • TPM < 0.5：基本不表达，即使依赖概率高也要怀疑数据噪声（或提示该基因以非表达依赖方式起效，如基因组不稳定）。

第四步：排除拷贝数干扰

在「基因拷贝数评估」（/GeneCn）确认目标位点没有大面积缺失：估计拷贝数 < 1 的系，CRISPR 切割后更容易因"残余单拷贝被切完"而呈现假阳性表型；拷贝数 ≥ 2 的系才能干净地解读"依赖 = 基因功能"。

实践组合示例

假设研究 GJB6 在皮肤癌中的作用：GeneCn 查得某皮肤细胞系拷贝数 ≈ 2（无缺失）→ GeneExpr 显示 TPM ≈ 40（高表达）→ GeneRisk 显示依赖概率 0.91 → 该系即为首选验证模型；再选一条"高表达但不依赖"的系做阴性对照，一组干净的敲除实验就设计完了。

提示：正式实验前请核对细胞系的 STR 认证与培养条件，DepMap 数据不代表可以直接照搬培养体系。